江蘇中輝-實驗小鼠核酸樣品單核苷酸多態(tài)性標記檢測的能力驗證結(jié)果評價
2023.02.08摘要：通過實施全國范圍的小鼠DNA核酸樣品單核苷酸多態(tài)性 （single nucleotide polymorphism，SNP） 標記檢測能力驗證計劃，檢測各實驗室小鼠遺傳質(zhì)控SNP檢測技術水平，推動核酸樣品及SNP檢測技術的應用。
目的 通過實施全國范圍的小鼠DNA核酸樣品單核苷酸多態(tài)性 （single nucleotide polymorphism，SNP） 標記檢測能力驗證計劃，檢測各實驗室小鼠遺傳質(zhì)控SNP檢測技術水平，推動核酸樣品及SNP檢測技術的應用。
方法 按照中國食品藥品檢定研究院2022年組織實施的“NIFDC-PT-365實驗小鼠DNA樣品SNP標記檢測能力驗 證計劃”方案要求，各參加實驗室均獲得 BALB/c 和 C57BL/6 來源的隨機編號 DNA 盲樣 2 份、作業(yè)指導書、 rs3023177和rs3023382 SNP位點引物2對。參與者在規(guī)定時限內(nèi)提交報告和原始記錄，突變位點擴增測序結(jié)果與方 案預設一致時判為滿意，否則判為不滿意。同時，對各實驗室的PCR擴增體系及測序比對方式進行比較，分析可能 影響小鼠核酸標準樣品SNP檢測結(jié)果的相關因素。
結(jié)果 10個參加實驗室在2個SNP位點的盲樣測序分型上皆與 預設一致，均獲得滿意結(jié)果。不同擴增體積 （20 µL、25 µL、30 µL）、不同Taq酶體系 （單組分與PCR MIX），以 及不同的測序公司、測序方向、比對軟件均未影響結(jié)果準確性。
結(jié)論 各參加實驗室在小鼠DNA核酸樣品SNP標 記檢測項目上均具有較強的檢測能力。SNP檢測技術在小鼠遺傳質(zhì)量評價中簡便易行，值得推廣。
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